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\bibliography{hoge} の行間が広すぎるのでどうしたものかと思ってたけど、 ここを参考に

\setlength{\parskip}{0pt}
\setlength{\itemsep}{0pt}
を、fuga.bblファイルに手作業で記述することで、一応、行間と項目間は狭まった。 この方法だと、jbibtexで参考文献リストを作り直すたびに手作業で書かなければいけなくて、とてもスマートとは言えないけど。

\parskip は効いてなかった。ここを参考に \baselineskip を変更したら、望みの結果となった。

\setlength{\baselineskip}{0pt}

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